Médecine et sciences de la santé – Thèses
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Item Accès libre Étude d'un potentiel système antiphage de type « avortement de l'infection » régulé par un ARN non codant chez Clostridioides difficile(Université de Sherbrooke, 2025) Saunier, Marion; Soutourina, Olga; Fortier, Louis-CharlesClostridioides difficile est une bactérie pathogène responsable d’infections intestinales sévères chez l’adulte, associées à l’antibiothérapie. Depuis le début des années 2000, la gravité des infections par C. difficile a augmenté en Amérique du Nord et en Europe, due à l’émergence de souches hypervirulentes. A ce jour, de nombreux aspects de la pathogénèse de C. difficile restent encore incompris. Il est maintenant bien établi que les ARNs non codants (ARNnc) jouent un rôle important dans la régulation de l’expression de gènes impliqués dans la virulence de nombreux pathogènes. Nos données de séquençage à haut débit ont montré l’existence de nombreux ARNnc chez C. difficile, dont certains sont spécifiques à la souche hypervirulente R20291. L’un d’eux, nommé RCd22, est localisé au sein du prophage phi027, en amont d’un gène codant pour une protéine hypothétique de type « Abortive infection » (Abi). Le système Abi est un système de défense dirigé contre les bactériophages (phages), et est basé sur le suicide de la bactérie avant que le phage ne puisse achever son cycle de réplication, évitant ainsi la dissémination du phage dans les bactéries voisines. C. difficile a développé des systèmes de défense antiphage efficaces lui permettant ainsi de survivre au sein de communautés intestinales riches en phages. Dans ce projet, nous avons montré que la surexpression du gène abi entraîne un ralentissement de croissance chez C. difficile mais également chez Escherichia coli. L’activité de cette protéine Abi est bactériostatique, ce qui est parfois observé pour certains systèmes Abi. Des expériences de 5’/3’-RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends) nous ont permis d’identifier les extrémités d’un court transcrit correspondant à l’ARNnc RCd22 et d’un long transcrit correspondant à la co-transcription de RCd22 et abi. Par des expériences de qRT-PCR et des fusions transcriptionnelles sur plasmide, nous avons montré que RCd22 avait un effet régulateur négatif sur le gène abi. De plus, RCd22 est capable de neutraliser l’activité toxique de Abi en cis et en trans. Une expérience MAPS (MS2-Affinity purification and sequencing) couplée à de la spectrométrie de masse nous a permis d’identifier la protéine Abi comme le principal partenaire d’interaction de RCd22. L’activité toxique de la protéine Abi est donc neutralisée par RCd22 grâce à une interaction protéine-ARNnc, ce qui est un mécanisme similaire au système toxine-antitoxine de type III. La structure du complexe RCd22-Abi a été modélisée par Alphfold3, nous permettant d’identifier des potentiels acides aminés et nucléotides clés dans la formation du complexe ou la toxicité de l’Abi. Des mutations dans la séquence de RCd22 impactant la structure de l’ARNnc ont révélé l’importance des structures tige-boucle dans deux motifs conservés, nommés abiF, dans la répression de l’activité toxique de Abi. Des mutations dans la séquence du gène abi ont révélés l’importance de deux acides aminés du domaine conservé ribonucléase dans l’activité toxique de la protéine. La fonction antiphage du système Abi de C. difficile a été testée. Pour cela, nous avons délété le gène abi, RCd22 ou les deux, et avons infecté ces souches par des phages de C. difficile. Ces expériences ont révélé qu’en absence du gène abi, l’infection par le phage était moins efficace, révélant un effet contraire à celui attendu. Étant un système localisé dans le prophage phi027 chez C. difficile, nous avons émis l’hypothèse que ce système pourrait avoir une autre fonction qui est celle du maintien du prophage dans le chromosome bactérien, comme cela a déjà été observé pour d’autres systèmes antiphages. De manière intéressante la délétion de RCd22 impacte l’induction du prophage par la mitomycine C. Dans l'ensemble, nos résultats démontrent que le potentiel système Abi est toxique chez C. difficile, que son activité est finement régulée par un ARNnc à plusieurs niveaux et que ce système semble jouer un rôle dans l’infection phagique.Item Accès libre Investiguer le rôle de Nat10 sur l’expression des gènes du VIH-1(Université de Sherbrooke, 2025) Da Rocha, Morgane; Bell, BrendanLa latence est actuellement l’obstacle majeur à l’éradication du virus de l’immunodéficience humaine (VIH). L’état de latence du virus est fortement entremêlé avec la régulation de sa transcription. Comprendre les mécanismes qui régulent la transcription des gènes du VIH pourrait donc être la clé nécessaire pour verrouiller le virus latent. Notre laboratoire a mis en évidence une séquence dans le promoteur du VIH qui est très conservée, et qui est reconnue par un complexe de protéines cellulaires spécifiques. Nous avons nommé ce complexe PICH, pour Pre Initiation Complex of HIV-1. Puis, nous avons identifié les protéines appartenant à PICH, et nous avons démontré que ces protéines ont un impact positif sur l’expression des gènes du VIH-1. Notre but à présent est de comprendre comment chacune de ces protéines régule le niveau d’expression des gènes du VIH-1. Ce projet se concentre sur la protéine Nat10, une N acétyltransférase cellulaire. Nat10 est une protéine connue pour interagir avec la protéine virale Tat. Notre hypothèse est que Nat10, à travers son interaction avec la protéine Tat, participe à la régulation de l’expression des gènes du VIH-1, et à l’établissement de sa latence. Nous avons trois objectifs. Tout d’abord, nous aimerions confirmer la présence de Nat10 au niveau du promoteur viral, et avoir une idée non biaisée de son rôle dans une lignée cellulaire lymphoïde. Ensuite, nous cartographierons le site d’interaction entre Nat10 et la protéine virale Tat. Finalement, nous déterminerons l’importance de la fonction acétyltransférase sur la régulation par Nat10 de l’expression des gènes viraux. Nos expériences d’immunoprécipitation de la chromatine ont démontré que Nat10 se trouve sur le promoteur du VIH-1. Nous avons ensuite analysé des expériences de séquençage des ARN d’une lignée de cellules lymphoïdes, en présence et en absence de Nat10, qui nous ont permis de déterminer que Nat10 influence l’expression des gènes impliqués dans les fonctions des lymphocytes T. Puis, nous avons identifié que la région N acétyltransférase/liaison à l’ARNt de Nat10 est nécessaire pour son interaction avec Tat. Finalement, nous avons observé que Nat10 est un régulateur positif de l’expression des gènes du VIH-1, et que les fonctions catalytiques de Nat10, notamment son activité N acétyltransférase, sont nécessaires pour permettre cette régulation. En conclusion, nos recherches ont permis de mettre en évidence que Tat interagit avec le domaine N-acétyltransférase/liaison à l’ARNt de Nat10. Nous avons également montré que Nat10 est un régulateur positif de l’expression des gènes du VIH-1, notamment grâce à l’action de ses activités catalytiques comme son activité N-acétyltransférase.Item Accès libre Assessment of urbanization, air pollution and water pollution as environmental risk factors of amyotrophic lateral sclerosis in New Brunswick(Université de Sherbrooke, 2025) Saucier, Daniel; Bélanger, Mathieu; O'Connell, ColleenBackground: Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a rare neurological disease resulting in progressive loss of voluntary muscle control. While genetic factors have been identified, the role of environmental influence in ALS development remains uncertain. Thus, we created a robust database from multiple sources to investigate the association between long-term exposure at place of residence to various local climate zones (urbanization), air pollutants, and proximity to water bodies with indicators of run-off sources and the development of ALS. Methods: A matched case-control study was conducted in New Brunswick (NB), Canada from January 2003 to February 2021. ALS cases were individually matched with respect to sex and year of birth with four randomly selected controls. Study population included 304 ALS patients and 1207 controls with their historical postal codes from the NB Citizen Database linked to spatial environmental datasets from the Canadian Urban Environmental Health Research Consortium to compare their environmental exposures prior to onset via conditional logistic regression models. Results: For urbanization, odds of ALS were not significantly associated with the local climate zone classification categories, nor for exposure to greenness, in the adjusted regression models. For air pollution, odds of ALS were significantly associated with increased SO2 exposure (Odds ratio, 95% confidence interval = 1.23, 1.02-1.47, per 0.14 ppb increase of SO2) in adjusted models, but not associated with the other studied air pollutants. For water pollution, the final fitted models suggested no association between proximity to water bodies with indicators of potential run-off sources and the development of ALS. Conclusions: Greater exposure to SO2, even at intensities below the Canadian Ambient Air Quality Standards green management levels, was associated with an increased risk of developing ALS. Further studies addressing replicating these results and addressing limitations of this study are needed.Item Accès libre Décoder les mécanismes de dissipation d'énergie chez l'humain pour la performance en environnements froids et l'usage thérapeutique(Université de Sherbrooke, 2025) Dumont, Lauralyne; Blondin, DenisAu cours des dernières années avec la redécouverte du tissu adipeux brun actif chez l’humain adulte, de nombreuses personnes ont vanté les mérites des expositions au froid sur plusieurs aspects physiologiques et psychologiques. Bien que le tissu adipeux brun ainsi que le muscle squelettique soient deux tissus thermogéniques qui jouent un rôle important dans le maintien de la température corporelle et de la balance énergétique, plusieurs éléments demeurent à être démystifiés. Cette thèse présente deux différentes approches à travers deux projets distincts dans le but de mieux comprendre les mécanismes de thermorégulation mis en place chez l’humain. Le premier projet examine l'interaction entre la thermogenèse frissonnante des muscles squelettiques et la thermogenèse non frissonnante des tissus adipeux (brun et blanc) chez des individus en bonne santé, hommes et femmes, en fonction de deux niveaux d'intensité de températures moyennes de la peau. Ce projet a permis de mettre en évidence que la production de chaleur corporelle totale est principalement régulée par le frissonnement des muscles squelettiques, et que ce phénomène est modulé en fonction de l’intensité du stress thermique appliqué. Contrairement aux anciennes croyances, les tissus adipeux quant à eux ne seraient pas activés de façon linéaire, en fait sa capacité serait active ou inactive et ne serait pas influencée par le degré du refroidissement. De plus, ce projet a permis d’établir une différence entre les sexes, où les femmes ont une intensité de frissonnement étant plus élevée que chez l’homme lors d’une exposition plus froide, et ce, en engageant préférentiellement les muscles du bas du corps. Le deuxième projet visait à stimuler la thermogenèse du tissu adipeux brun en administrant une dose suprathérapeutique de mirabegron, un agoniste du récepteur β3-adrénergique, seul ou en coadministration avec le bisoprolol, un antagoniste du récepteur β1-adrénergique. L’objectif était de réduire les effets cardiovasculaires du mirabegron tout en favorisant l'activation des récepteurs β2- et β3-adrénergiques. L’emploi d’un stress pharmacologique combiné du mirabegron et du bisoprolol a bel et bien diminué les effets cardiovasculaires du mirabegron, cependant à la dose utilisée, le bisoprolol a également diminué la thermogenèse, la lipolyse et la captation de glucose du tissu adipeux brun. Ensemble, les recherches présentées dans le cadre de cette thèse révèlent de nouvelles connaissances sur la thermophysiologie chez l’humain.Item Accès libre Formation d’invadosomes par les fibroblastes dans la fibrose pulmonaire idiopathique(Université de Sherbrooke, 2023) Lebel, Megane; Cantin, André; Dubois, ClaireLa fibrose pulmonaire idiopathique (FPI) est une maladie mortelle caractérisée par une perte d’intégrité de l’épithélium alvéolaire, suivi d’une accumulation anormale de fibroblastes dans l’interstice pulmonaire. Ces derniers assurent une déposition et un remodelage soutenu de matrice extracellulaire (MEC) menant à une perte de fonction pulmonaire. Cependant, les mécanismes cellulaires impliqués dans le caractère invasif des fibroblastes sont encore peu compris. Bien caractérisé chez les cellules cancéreuses invasives, l’invadosome est une structure cellulaire composée d’actine et de protéines spécifiques telles que la protéine d’échafaudage TKS5, de manière à former une protrusion membranaire capable de sonder et de dégrader la MEC. Plusieurs éléments induisent la formation d’invadosomes, tels que l’hypoxie, l’acide lysophosphatidique (LPA) et le PDGF. Ces facteurs sont aussi présents et impliqués dans le développement de la FPI, entre autres en promouvant l’accumulation des fibroblastes dans le poumon et leur capacité à remodeler la MEC. Ainsi, nous avons étudié la capacité des fibroblastes pulmonaires à former des invadosomes. Dans le premier chapitre, nous avons confirmé la présence d’hypoxie dans les poumons d’un modèle murin de fibrose pulmonaire. Nous avons démontré que l’hypoxie augmentait la formation d’invadosomes dans les fibroblastes de poumons sains en impliquant la signalisation du LPA1 et des RTKs, en plus de favoriser l’expression de TKS5. Dans le second chapitre, nous avons révélé une signature génique pro-invadosomale dans les tissus et les foyers fibroblastiques de poumons FPI et constaté que TKS5 était exprimé de manière préférentielle par les fibroblastes et les tissus de poumons FPI. Aussi, les fibroblastes FPI avaient une capacité accrue à former des invadosomes, ce qui dépendait de l’expression de TKS5 et corrélait avec la sévérité locale de la fibrose. De plus, le nintedanib et la pirfénidone, les deux traitements de première ligne contre la FPI, inhibaient la formation d’invadosomes. Le nintedanib réduisait la phosphorylation d’Akt et l’expression de TKS5, deux évènements requis pour la formation d’invadosomes chez les fibroblastes FPI. En conclusion, notre travail suggère un nouveau mécanisme cellulaire par lequel les fibroblastes s’accumulent dans l’interstice alvéolaire et assurent le remodelage dansItem Accès libre Évaluation du contexte et des besoins décisionnels pour intégrer les soins centrés sur la personne dans la gestion de la douleur chronique au Canada : l’enquête pancanadienne DÉCIDE-DOULEUR(Université de Sherbrooke, 2025) Naye, Florian; Décary, Simon; Tousignant-Laflamme, YannickINTRODUCTION. Le plan stratégique fédéral contre la douleur recommande l'intégration de la prise de décision partagée dans les consultations en douleur chronique. Toutefois, les interventions actuelles en prise de décision partagée dans ce contexte spécifique ont une efficacité limitée. La faible qualité du développement de ces interventions peut expliquer ces résultats. Dans l’objectif de développer une intervention de haute qualité méthodologique, il est nécessaire de réaliser une évaluation du contexte et des besoins décisionnels. OBJECTIFS. 1. Identifier le contexte décisionnel incluant les décisions difficiles vécues, la décision jugée comme étant la plus difficile et les rôles assumé et préféré pendant cette prise de décision. Nous avons également mesuré le conflit décisionnel et le regret de la décision associés à cette décision jugée comme étant la plus difficile. 2. Identifier les besoins décisionnels en trouvant les facteurs associés au conflit et au regret. MÉTHODES. Nous avons mené une enquête transversale pancanadienne en ligne en suivant les recommandations du Checklist for Reporting of Survey Studies. Grâce au panel de Leger Marketing, nous avons recruté un échantillon aléatoire stratifié et proportionnel d’adultes vivant avec une douleur chronique non cancéreuse. Les données recueillies comprenaient : i) les décisions difficiles rencontrées, ii) le niveau de conflit décisionnel (mesuré avec l’échelle du conflit décisionnel (ECD)) et de regret décisionnel (mesuré avec l’échelle du regret de la décision (ERD)), et iii) les besoins décisionnels. Nous avons effectué des analyses descriptives et des analyses de régression multiniveau. RÉSULTATS. Nous avons recruté 1649 personnes. Obj 1. Nous avons constaté que 96 % des individus avaient rencontré au moins une décision difficile au cours de leur parcours de soins. Obj 2. Un tiers des personnes (33,7 %) ont présenté un conflit décisionnel cliniquement significatif (score ECD ≥ 37,5/100). Nous avons identifié 17 facteurs de risque associés à ce conflit décisionnel. Obj 3. La moitié des individus (50 %) ont éprouvé un niveau important de regret de la décision (score ERD > 25/100). Nous avons identifié 15 facteurs associés au regret de la décision. CONCLUSION. Les personnes vivant avec la douleur chronique au Canada font face à des besoins décisionnels non comblés et nécessitent du soutien pour optimiser leurs décisions dans la gestion de leur douleur. Cette étude transversale offre une compréhension du contexte et des besoins de cette population, établissant ainsi les bases pour le développement d’un futur prototype d’outil d’aide à la décision.Item Accès libre Approche neuroprotectrice de l’ostéopathie chez les grands prématurés : tolérance, sécurité et bénéfices potentiels(2025) O'Connor, Sandra; Lafrenaye, Sylvie; Gagneur, ArnaudIntroduction : Les prématurés sont vulnérables aux stimuli et manipulations, et le stress qui en découle peut nuire à leur développement. Bien que des études italiennes rapportent des bénéfices, les interventions ostéopathiques (IO) en néonatalogie restent peu étudiées quant au stress et à la neuroprotection. Aucune étude n'a évalué la réponse des prématurés aux IO dans un cadre pragmatique ni examiné leur tolérance selon les signes physiocomportementaux, indicateurs clés du stress ou du calme, parmi lesquels figure la réponse cardiaque. Absentes au Québec, les IO requièrent une évaluation rigoureuse avant leur intégration clinique. Cette étude explore les effets des IO intégrant des stratégies neuroprotectrices (SNP) inspirées des soins de développement, visant à limiter le stress et optimiser leur sécurité et bénéfices potentiels. Objectifs : 1- Évaluer, en intra-sujet et longitudinalement, la tolérance via la réponse cardiaque immédiate et à court terme des grands prématurés aux IO+SNP, en comparaison aux soins usuels (SU+SNP). 2- Confirmer leur sécurité à partir des alarmes et événements cardiorespiratoires. 3- Documenter l’âge chronologique (AC) pour atteindre l’autonomie respiratoire, alimentaire et le congé à domicile. Méthodologie : Onze prématurés (âge gestationnel à la naissance < 32 semaines) ont participé à une série d’études à cas unique, totalisant 153 paires de conditions (SU et IO, avec SNP) alternées aléatoirement, enregistrées en vidéo, incluant les 10 minutes avant et après. Les données ont été extraites des vidéos et des dossiers médicaux. Analyses selon les objectifs : (1) individuelles (visuelles, graphiques) et groupées (modèles mixtes) ; (2 et 3) descriptives. Résultats/discussion : Les IO+SNP ont été bien tolérées et sécuritaires chez des prématurés plus vulnérables que ceux des études antérieures. Une réduction significative de la fréquence cardiaque moyenne (jusqu’à 4 bpm) a été observée pendant et après les interventions, suggérant des bénéfices en termes d’apaisement et d’autorégulation, avec un effet croissant selon l’âge post-menstruel. Les SU+SNP n’ont pas montré d’effets comparables. Les AC d’autonomie doivent être interprétés avec prudence, les bébés inclus étant plus vulnérables que dans les études antérieures, ouvrant néanmoins une piste pour cette population. Conclusion : Les IO+SNP représentent une approche sécuritaire et prometteuse pour soutenir l’autorégulation des grands prématurés, offrant une intervention potentiellement complémentaire aux soins neuroprotecteurs actuels et ouvrant la voie à de futures études sur leurs bénéfices potentiels.Item Accès libre Étude de la densité de la matière grise au niveau cérébral et des questionnaires cliniques chez les personnes atteintes de lombalgie chronique : une étude longitudinale observationnelle(2025) Sean, Monica; Whittingstall, Kevin; Tétreault, Pascal; Léonard, GuillaumeLa lombalgie chronique est l’une des principales causes d’invalidité dans le monde. Plusieurs études ont montré des différences au niveau de la densité de matière grise (DMG) cérébrale qui était associée à la lombalgie chronique. Selon les écrits scientifiques, la majorité des études montrent une diminution de DMG au niveau de certaines régions du cerveau chez des personnes atteintes de lombalgie chronique avec une sévérité de symptômes modérée à sévère pouvant prendre des traitements pharmacologiques prescrits pour la douleur. Toutefois, les traitements pharmacologiques prescrits pour la douleur sont des facteurs confondants importants, puisqu’ils peuvent modifier la matière grise au niveau cérébral. Cela suggère que nous ne savons pas si cette diminution de DMG est attribuable au traitement pharmacologique, la condition de lombalgie chronique ou un mélange de ces deux facteurs. Dans cette thèse, nous nous sommes demandé si les personnes atteintes de lombalgie chronique ne prenant aucun traitement pharmacologique prescrit pour la douleur pouvaient avoir une différence de DMG cérébrale. Pour ce faire, dans l’article #1, nous avons montré qu’en incluant des individus sans antécédent ni traitement pharmacologique prescrit actuel pour la douleur, nous avons recruté une population atteinte d’une sévérité de symptômes faible à modérée et que la majorité des questionnaires ont montré une amélioration de leurs symptômes. Dans l’article #2, nous avons montré que même chez des individus atteints d’une sévérité de symptômes faible à modérée, il est possible d’observer des altérations au niveau de la DMG cérébrale. Plus précisément, nous avons montré une augmentation de la DMG cérébrale plus particulièrement au niveau du lobe temporal médian et lobe frontal chez les individus atteints de lombalgie chronique comparativement aux témoins sains. Puisque la sévérité des symptômes de la population étudiée était différente de celle de la population étudiée dans les études antérieures par d’autres équipes de recherche, nous avons cherché à savoir si les différences obtenues étaient dues à l’absence de traitement ou à la sévérité des symptômes. Dans le chapitre #3, nous avons montré que les personnes participantes dans notre échantillon ayant les symptômes les plus faibles différaient, en termes de DMG, de ceux présentant des symptômes modérés. Ensemble, ces résultats suggèrent que l’intensité des symptômes peut être associée, en partie à la DMG.Item Accès libre Étude qualitative des effets perçus de la pratique psychomotrice sur le développement des enfants(2024) Vabre, Pauline; Bouffard, Chantal; Dubois, Marie-France; Monzée, JoëlLa psychomotricité a été introduite, depuis plus de 20 ans, dans les écoles du Centre de services scolaire du Lac-Saint-Jean, à l’initiative des intervenants scolaires en difficulté auprès de certains enfants. Si la psychomotricité est une discipline en plein essor sur le plan clinique, le constat est plus nuancé d’un point de vue scientifique. Pourtant, il est nécessaire de faire émerger des données probantes afin de mieux cerner les bénéfices constatés empiriquement et d’assoir ainsi théoriquement et scientifiquement cette discipline. L’objectif général de cette étude était de rendre compte des effets perçus de la pratique psychomotrice sur le développement global d’enfants de 5 à 7 ans de la région du Lac-Saint-Jean, à partir du point de vue d’adultes de leur entourage scolaire et familial. Pour atteindre cet objectif, nous avons adopté une approche de recherche qualitative de type exploratoire et descriptive en réalisant des entrevues semi-dirigées auprès de 21 personnes, faisant partie de l’entourage scolaire et familial d’enfants participants aux séances de psychomotricité. Les données ont fait l’objet d’une analyse qualitative inductive assistée du logiciel Nvivo 12. Quatre grandes catégories émergent en lien avec la perception des effets de la psychomotricité. (1) Stimuler le développement de l’enfant, illustre les apports perçus de la pratique sur le développement de l’enfant; (2) Développer les pré-requis aux apprentissages, c’est-à-dire l’importance d’avoir acquis un certain développement pour être prêt et disponible aux exigences scolaires; (3) S’inspirer de la psychomotricité pour adapter le système scolaire aux besoins des enfants renseigne sur l’apport original de la psychomotricité dans les apprentissages ; (4) Soutenir la pratique des intervenantes scolaires du milieu fait référence à la démarche réflexive professionnelle. Autant par les intervenantes scolaires que par les parents, cette pratique est perçue comme une intervention permettant à la fois de varier les sources d’apprentissage, de diminuer la pression de performance et, de mieux connaître les enfants. En conclusion, les effets de la psychomotricité perçus par les participants sont multiples et touchent aux différentes sphères du développement des enfants. Cette étude invite à réfléchir aux programmes éducatifs proposés aux enfants en lien avec leurs propres capacités, rythmes et besoins développementaux.Item Accès libre Segmentation et classification des pathologies pulmonaires par apprentissage profond : intégration de la transformée en ondelettes discrètes et des mécanismes d’attention(Université de Sherbrooke, 2025-04-01) Alaoui Abdalaoui Slimani, Faiçal; Bentourkia, M'HamedL'intelligence artificielle (IA), et plus particulièrement l'apprentissage profond (DL), révolutionne le domaine du traitement des images, notamment dans l'analyse des images médicales. Les réseaux de neurones convolutifs (CNN) occupent une place importante dans les tâches de segmentation et de classification. En imagerie thoracique (chest X-rays, CXR), ces techniques montrent un fort potentiel pour assister les radiologues dans le diagnostic des maladies pulmonaires, malgré les défis liés à la diversité des pathologies et au manque de données annotées de haute qualité. Les besoins en santé publique sont accrus par la charge des maladies respiratoires. Selon le rapport de l’organisation mondiale de la santé (OMS), plus de 65 millions de personnes souffrent de bronchopneumopathie chronique obstructive (BPCO), avec 3 millions de décès par an, tandis que la pneumonie a causé 808 694 décès chez les enfants de moins de 5 ans en 2017. Cette thèse propose une approche de segmentation et de classification pour l’analyse des images CXR, optimisée par l’intégration de la transformée en ondelettes discrètes (DWT) dans le modèle U-Net++, permettant de remplacer les opérations de max-pooling par une réduction de résolution plus précise, préservant des détails structurels essentiels. De plus, l’utilisation de mécanismes d’attention améliore la précision en focalisant l’analyse sur les zones d’intérêt, en particulier dans les cas de densités élevées, comme dans les infections sévères. Pour la classification, une architecture CNN en deux étapes combine VGG-19 pour la première classification générale (poumons normaux, tuberculose, pneumonie) et DenseNet-201 pour distinguer les cas de pneumonie de ceux de COVID-19, augmentant ainsi la sensibilité et la spécificité du modèle. Pour compenser le manque de données annotées, le modèle Progressive Growing GAN (PGGAN) est utilisé pour générer des images synthétiques, enrichissant les ensembles d’entraînement et renforçant la robustesse du modèle. Les résultats obtenus montrent une amélioration des performances de segmentation et de classification, soulignant le potentiel de ces techniques pour alléger la charge de travail des radiologues et améliorer la qualité des soins via des outils de diagnostic assisté par IA, contribuant ainsi de manière transformative aux applications cliniques.Item Accès libre G-quadruplexes dans le contexte de la maladie de Parkinson(Université de Sherbrooke, 2025-03-28) Turcotte, Marc-Antoine; Perreault, Jean-PierreLes maladies neurodégénératives sont des fléaux présents dans notre population vieillissante. Parmi celles-ci, la maladie de Parkinson se caractérise par la mort des neurones dopaminergiques dans la substance noire du cerveau. Il a été montré qu’une structure nucléotidique particulière, un G-quadruplex (G4), est associée à certaines maladies neurodégénératives. Un G4 se caractérise par l’empilement de quartets de guanines stabilisés par des cations monovalents, habituellement le potassium. Malheureusement, les stratégies de détection et de ciblage de ces structures ont encore besoin d’amélioration. Dans le cadre de cette thèse, de nouveaux outils ont été développés pour détecter et cibler les G-quadruplexes. Dans un premier temps, des techniques in silico, in vitro et in cellulo ont été combinées pour mettre au point une procédure optimisée afin d’identifier de nouveaux G-quadruplexes d’ARN. Cette combinaison de techniques a permis de jumeler les points positifs et d’éliminer les points négatifs de chacune d’entre elles. De ce fait, la nouvelle méthode développée possède une spécificité de détection positive à plus de 85%. Dans un deuxième temps, l’effet de petits polymorphismes nucléotidiques (SNP) se localisant dans de potentiels G-quadruplexes sur leur reconnaissance par des ligands stabilisateurs de G4 a été exploré. Cette étude a permis de montrer que certains SNP contribuent à la formation de G4 et à l’interaction avec certains ligands tandis que d’autres en diminuent l’affinité. L’application de l’étude à l’⍺-synucléine, une protéine nocive chez les patients atteints de la maladie de Parkinson, ouvre une nouvelle voie de traitement pour cette maladie basée sur les ligands à G4 et les SNP présents chez les patients. Dans un troisième temps, une nouvelle stratégie d’inhibition de la monoamine oxydase B (MAOB), une enzyme responsable de la dégradation de la dopamine, a été mise au point. Pour ce faire, un G-quadruplex non canonique ayant un effet négatif sur la traduction a été identifié dans la région 5′ non traduite du transcrit de MAOB. Afin d’accentuer cet effet inhibiteur, des oligonucléotides antisens possédant une région riche en guanines (G-ASO) ont été développés pour former un G-quadruplex canonique intermoléculaire. L’effet de ces G-ASO a conduit à une augmentation de l’inhibition de la traduction in vitro et in cellulo. Pour résumer, les travaux de cette thèse ont permis d’approfondir nos connaissances relatives aux G-quadruplexes, soit leurs techniques de détection et de ciblage. Cette thèse s’intègre parfaitement dans un domaine en effervescence, soit les thérapies de l’ARN.Item Accès libre Soutenir les parents dans l’adhésion aux stratégies de prévention des déformations crâniennes positionnelles(Université de Sherbrooke, 2025-03-19) Trottier, Nathalie; Gaboury, IsabelleLa plagiocéphalie (déformation du crâne en forme de parallélogramme) et la brachycéphalie (aplatissement symétrique de l’occiput) sont des déformations crâniennes positionnelles (DCP) courantes chez les nourrissons et sont souvent associée à des retards de développement et à des asymétries. Cette problématique peut être évitée chez de nombreux nourrissons grâce à des stratégies de prévention mises en œuvre dès la naissance. Cependant, l'adhésion des parents à ces stratégies reste un défi. Les facteurs influençant cette adhésion n'ont pas encore été identifiés de manière exhaustive. Ce projet a pour objectifs d’identifier et de mieux comprendre les facteurs qui influencent l'adhésion des parents aux stratégies de prévention de la DCP. Méthode : Une étude multiméthodes a été menée au Québec. Une revue de portée a d'abord été réalisée afin de fournir un aperçu de l'état des connaissances sur le sujet, ce qui a guidé la planification et la réalisation de ce projet Les parents de nouveau-nés (n=218) ont répondu à une enquête en ligne disponible d'octobre 2022 à octobre 2023, comprenant 39 questions à échelle de Likert, 12 questions démographiques et une question ouverte. L’enquête a été élaborée selon le Cadre des Domaines Théoriques (TDF) et le modèle Capacité, Opportunité, Motivation pour le changement de comportement (COM-B). La question ouverte (n=112) visait à identifier les obstacles à l'adhésion des parents. Ensuite, 15 parents intéressés ont participé à des entrevues semi-structurées. Les données ont été analysées par des analyses descriptives pour les questions à échelle de Likert et une thématisation déductive-inductive des réponses ouvertes et des entrevues. Résultats : Les facteurs influençant l'adhésion parentale ont été regroupés en trois thématiques principales : les caractéristiques des messages de prévention, l'optimisation de l'environnement, et les priorités des parents de nouveau-nés. Ces thématiques sont également influencées par l'évolution des compétences parentales et les progrès du développement du bébé. Conclusions : Ce projet doctoral met en évidence l'importance d'adapter les stratégies de prévention des DCP chez les nouveau-nés en optimisant les messages, en individualisant les interventions selon les besoins des familles et les étapes de développement de l'enfant, tout en créant des environnements favorables. Il souligne également que le bien-être familial et le plaisir ressenti dans l'application des stratégies sont des facteurs clés pour une adhésion parentale durableItem Accès libre Coconstruction d’un service de répit flexible à domicile pour les personnes proches aidantes de personnes aînées : une approche de laboratoire vivant(Université de Sherbrooke, 2025-03-19) Viens, Maude; Provencher, Véronique; Carrier, AnnieIntroduction : Le répit fait partie des services à domicile pouvant être offerts aux personnes proches aidantes de personnes aînées (PPA). Bien que les meilleures pratiques en matière de répit soient ancrées dans une approche centrée sur la personne, celui-ci est rigide et difficile d’accès. Il est donc essentiel de développer sa flexibilité, afin que ce service soit mieux adapté aux conditions de santé, aux préférences et aux besoins changeants des PPA. Objectif : Le but de ce projet était de coconstruire un modèle de répit flexible à domicile. Spécifiquement, il visait à 1) synthétiser les connaissances quant aux caractéristiques d’un tel répit ainsi qu’aux leviers et aux obstacles à sa mise en œuvre. Ensuite, à partir de la synthèse des connaissances, le projet visait à 2) documenter empiriquement les caractéristiques d’un répit à domicile flexible ainsi que les leviers et les obstacles à considérer dans sa mise en œuvre. Méthodes : Appuyé des cadres de Maayan (QUI, QUAND) et Damschroder (Consolidated Framework for Implementation Research) et leurs collaborateurs, ce projet multiméthodes a adopté une approche de laboratoire vivant. Une étude de la portée a synthétisé la littérature (obj.1), tandis que des ateliers de coconstruction (méthodes TRIAGE et persona-scénario) et des entrevues individuelles ont permis de déterminer les caractéristiques du modèle de répit flexible nommé ANAAIS (obj.2). Les données ont été soumises à une analyse thématique de contenu. Résultats : La flexibilité du répit peut être comprise à travers 3 dimensions (obj.1) : 1) QUI l’offre, 2) QUAND et 3) COMMENT il est offert. L’adaptabilité du modèle de service est considérée comme un levier à la mise en œuvre du répit flexible, tandis que sa complexité et les conditions locales sont perçues comme des obstacles. Les parties prenantes ont coconstruit une version québécoise d’ANAAIS (obj.2) ; cette application web permettrait à une PPA de demander du répit au moment souhaité, offert par une personne qualifiée, via une application web simple et abordable. Les politiques et les lois sont perçues comme un levier à la mise en œuvre, tandis que le financement est considéré comme un obstacle. Conclusion : Ces résultats constituent une première étape vers une opérationnalisation du répit à domicile flexible, en plus de documenter les leviers et les obstacles perçus à son implantation. En adoptant une approche participative et pragmatique de la recherche, ce projet propose des modèles de répit en intégrant des solutions flexibles et adaptées aux besoins individuels.Item Accès libre Association entre les services de raccompagnement et les collisions routières dans les villes du Québec(Université de Sherbrooke, 2025-02-18) Mamri, Asma; Ouimet, Marie Claude; Nazif-Munoz, José IgnacioAu Québec, la proportion des collisions mortelles liées à l'alcool varie de 20 % à 30 %. Face à ce fléau, les services de raccompagnement (SR) sont proposés comme une solution pour prévenir la conduite avec les capacités affaiblies (CCA). Toutefois, les SR sont souvent confondus avec d’autres formes de transport alternatif, comme le covoiturage à but lucratif. Une revue critique, utilisant une analyse thématique, a permis d’identifier les caractéristiques propres aux SR et de recenser six études évaluant leur association avec la CCA; la majorité d’entre elles ayant été menées aux États-Unis il y a plus de 20 ans. L’objectif principal de la thèse est d’évaluer l’introduction (1978-1995) et la présence (2000-2019) d’un SR dans les villes du Québec (Montréal, Québec, Sherbrooke et Trois-Rivières). Pour la période 1978 à 1995, les variables dépendantes étaient les taux hebdomadaires de collisions i) nocturnes et ii) nocturnes durant les fins de semaine. La variable indépendante était les taux de raccompagnements fournis par le SR. Un devis de séries temporelles interrompues a été utilisé pour évaluer le SR dans l'ensemble des villes et dans chacune d’entre elles, en utilisant des périodes pré-post interventions équivalentes. Un modèle autorégressif intégré à moyenne mobile a été utilisé pour analyser les données. Les résultats n’ont pas démontré d'association significative (p > 0,05) que ce soit pour l’ensemble des villes ou pour chacune d’entre elles entre les taux de raccompagnements offerts et i) les taux de collisions nocturnes et ii) les taux de collisions nocturnes pendant les fins de semaine. Pour la période de 2000 à 2019, les variables dépendantes étaient le nombre mensuel de collisions nocturnes associées à l’alcool. La variable indépendante était le nombre de raccompagnements fournis par le SR. Les données étaient organisées en panel. Des modèles de régression binomiale négative à effets aléatoires ont été utilisés pour analyser les données. Les résultats n'ont montré aucune association statistiquement significative (p > 0,05) entre les nombres mensuels de raccompagnements fournis par le SR et les collisions nocturnes liées à l'alcool. En conclusion, cette thèse a clarifié la conceptualisation des services de raccompagnement et évalué leur contribution dans la prévention des collisions au Québec. Ces programmes devraient être considérés comme une stratégie secondaire, intégrée à une approche multidimensionnelle, visant à réduire les inégalités socio-économiques et régionales en matière d'accès au transport sécuritaire.Item Accès libre Attitudes et conséquences associées aux intentions liées au contrôle du poids de l’adolescence à l’âge adulte(Université de Sherbrooke, 2025-02-10) Thibault, Véronique; Bélanger, MathieuIntroduction: Près de la moitié des jeunes ont une image corporelle négative et ont l’intention de contrôler leur poids. La littérature n’est pas claire quant à l’influence de l’image corporelle sur les intentions liées au contrôle du poids et les conséquences des intentions liées au contrôle du poids sur la santé des jeunes. Cette thèse vise à évaluer le lien entre l’image corporelle et les intentions liées au contrôle du poids, et le lien entre les intentions liées au contrôle du poids, les habitudes de vie et l’adiposité à long terme chez les adolescents et les jeunes adultes. Méthodologie: Des analyses secondaires de données de deux études longitudinales canadiennes, soit MATCH et NICO, ont été réalisées. Ces études ont recueilli des données auto-rapportées auprès de plus de 900 participants plusieurs fois par année durant l’adolescence et le début de l’âge adulte. Des équations d’estimation généralisées, des régressions à effet fixe et des analyses de médiation ont été utilisées. La plupart des analyses ont été stratifiées selon le genre. Résultats: Un score plus élevé d’émotions négatives liées au corps et une préoccupation élevée par rapport au poids étaient associés à l’intention de perdre du poids. L’intention de perdre du poids était associée à des comportements de santé favorables (consommation plus élevée de fruits et légumes) et moins favorables (consommation plus faible de déjeuner et temps d’écran plus élevé) chez les adolescents. L’intention de prendre du poids ou de maintenir son poids était généralement associée à des comportements plus favorables en matière de santé. L’intention de perdre du poids pendant l’adolescence n’était pas à associée à un changement de poids au début de l’âge adulte. Conclusion: Les émotions et les préoccupations à l’égard du poids peuvent être des cibles d'intervention en matière de santé, car elles représentent d'importants prédicteurs de l’intention de contrôler son poids. Toutefois, les intentions liées au contrôle du poids ne mènent pas toujours à des comportements de santé favorables ou à un changement d’adiposité à long terme. Une approche neutre en matière de poids, soit qui priorise la santé au lieu du poids, semble être à préconiser pour améliorer la santé des jeunes.Item Accès libre The innovative role of DUSP4 in kidney disease : from diabetic to end-stage kidney disease(Université de Sherbrooke, 2025-01-27) Rousseau, Marina; Geraldes, Pedro MiguelAbstract : Diabetic kidney disease (DKD), a form of progressive chronic kidney disease, is the leading cause of end-stage kidney disease (ESKD) in North America. Chronic kidney disease (CKD) is characterized by a gradual decline in renal function. Unfortunately, the kidneys of patients who reach ESKD are at a point of no return, and they will eventually need dialysis or transplantation. Therefore, it is imperative that we find treatments that will be able to slow or even stop the progression of CKD. DUSP4 (Dual Specificity Phosphatase 4) expression is notoriously downregulated in the diabetic kidney, and its loss has been associated with disease progression. Notably, podocyte loss is a significant event in the progression of DKD. The loss of insulin signalling has been associated with podocyte dysfunction and loss. The mechanisms of insulin resistance have been extensively studied, but little is known about the crosstalk between the pathways in podocyte insulin resistance. The first section of this thesis sought to explain the crosstalk between DUSP4 loss, MAPK activation, and oxidative stress in high glucose-mediated podocyte insulin resistance. We observed that oxidative stress contributed to high glucose-induced DUSP4 reduction, resulting in MAPK overactivation, which increased Nox4 expression. Interestingly, the deregulation of Nox4 expression mediated podocyte insulin resistance via inhibitory serine307 phosphorylation of IRS1. The deletion of DUSP4 in diabetic mice resulted in Nox1/4 upregulation, which contributed to substantial insulin resistance. Interestingly, the loss of DUSP4 also exacerbated glomerular and tubular fibrosis, characteristics of advanced CKD. Therefore, in the second section of this thesis, we wanted to understand the impact of DUSP4 loss on the mechanisms of tubulointerstitial fibrosis (TIF). Our results show that DUSP4 deletion worsened TIF, associated with increased myofibroblast accumulation, inflammatory M1 macrophage infiltration, and massive inflammation. However, the systemic overexpression of DUSP4 prevented disease progression. We observed that the overexpression of DUSP4 solely in macrophages provided anti-inflammatory effects but did not improve fibrosis. Furthermore, DUSP4 overexpression increased fibroblast proliferation, an essential characteristic of activated fibroblasts. However, DUSP4 overexpression attenuated markers of tubular epithelial to mesenchymal transition, a process that contributes to total levels of fibrosis. In conclusion, our results help us better understand the protective role that DUSP4 plays in podocytes and tubular epithelial cells of the kidney in progressive CKD.Item Accès libre Repositionnement préclinique du fulacimstat, un inhibiteur de la chymase oralement biodisponible, dans le renversement de thromboses et thromboembolies carotidiennes(Université de Sherbrooke, 2025-01-22) Vincent, Laurence; D'Orléans-Juste, PedroLa thrombose artérielle, responsable de l’infarctus du myocarde et de l’accident vasculaire cérébrale (AVC) ischémique, est actuellement traitée par des fibrinolytiques de la classe des activateurs tissulaires du plasminogène (tPA) comme l’altéplase. Toutefois, leur utilisation est limitée en raison de la fenêtre thérapeutique étroite et du risque de saignement intracrânien associé à ces médicaments. Par conséquent, le développement d’une nouvelle classe de fibrinolytiques artériels sans effets sur l’hémostase est crucial pour répondre à un besoin clinique non satisfait. La chymase, une enzyme mastocytaire impliquée dans la formation d’angiotensine II, a été récemment identifiée par notre laboratoire, comme facteur clé dans la thrombose veineuse expérimentale. Notre laboratoire a en effet démontré qu’un inhibiteur de la chymase prévient et renverse la thrombose veineuse profonde (TVP) chez la souris, sans affecter l’hémostase. Séquestrée sous forme active à l’intérieur du thrombus, la chymase inactive la plasmine, la seule enzyme directement impliquée dans la dissolution des complexes croisés de fibrine qui composent les caillots et thrombi sanguins. Le présent projet a pour but principal d’évaluer les propriétés profibrinolytiques artérielles du fulacimstat (BAY1142524), un inhibiteur spécifique de la chymase oralement biodisponible et dont l’innocuité et l’absence d’effet sur les facteurs de coagulation ont été confirmées dans des études cliniques. L’hypothèse principale de cette thèse est que le fulacimstat corrige la thrombose carotidienne par un mécanisme impliquant l’activation de la plasmine, et améliore les morbidités liées à l’AVC sans augmenter les risques de saignement, contrairement à l’altéplase. Dans un premier temps, nous avons rapporté que la chymase recombinante humaine réduit les propriétés fibrinolytiques de la plasmine endogène dans des caillots de sang humain en présence de l’altéplase, de manière sensible au fulacimstat. Cette méthode in vitro nous a également permis de développer un nouvel essai de biomarqueur pour mesurer l’inhibition de la chymase par la fraction plasmatique libre du fulacimstat. Une activité chymase sensible au fulacimstat a également été identifiée dans des biopsies humaines d’embolies pulmonaires. En deuxième lieu, nous rapportons que le fulacimstat prévient et renverse la thrombose carotidienne induite par dommage vasculaire au chlorure de fer (FeCl3) chez la souris et le hamster, de manière dépendante de la dose et sensible à l’inhibition de la plasmine par le BAY 1214237. De plus, l’administration post-thrombose du fulacimstat rétablit le flux sanguin, mesuré par échographie Doppler. En dernier lieu, dans un modèle expérimental de thromboembolie cérébrale chez la souris, le fulacimstat améliore les paramètres neurocomportementaux et prévient les lésions cérébrales corticales. Les résultats de cette étude supportent l’utilisation des inhibiteurs de la chymase comme le fulacimstat, en tant que stratégie profibrinolytique pour le renversement des pathologies thrombotiques et thromboemboliques, sans affecter l’hémostase.Item Accès libre The gut microbiota in myotonic dystrophy type 1(Université de Sherbrooke, 2025-01-22) Mahdavi Mazdeh, Manijeh; Massé, Éric; Gagnon, CynthiaAbstract: Myotonic dystrophy type 1 (DM1) is a rare autosomal dominant genetic disorder. Although DM1 is primarily characterized by progressive muscular weakness, it exhibits many multisystemic manifestations, such as cognitive deficits, cardiac conduction abnormalities, and cataracts, as well as endocrine and reproductive issues. Additionally, the gastrointestinal (GI) tract is frequently affected, encompassing the entire digestive tract (difficulty swallowing, constipation, diarrhea). However, the underlying causes of these GI symptoms remain uncertain, whether it is due to intestinal biomechanical problems, or involvement of bacterial communities, or both. The primary objective of this study is to investigate structural changes in the gut microbiome of DM1 patients. To achieve this purpose, we used both human and humanized mice models. In the human samples, 35 patients with DM1 were recruited from Saguenay–Lac-St-Jean region of the province of Québec, Canada. For mice samples, we used 68 stools samples from Homozygous (carrying human mutated alleles), Heterozygous, and WT of a transgenic mice model (DMSXL). We collected stool samples and then sequenced by MiSeq and analyzed by DADA2 to generate taxonomic profiles. Our analyses revealed that in both human and mice models, the DM1 status correlated with gut bacterial community changes with significant differences observed in beta diversity but not in alpha diversity. Notably, there were differences in the relative abundance of Bacteroidota, Euryarchaeota, Fusobacteriota, and Cyanobacteria phyla compared to human healthy controls. As for mice samples, the DM1 mice demonstrated significant changes in the bacterial structure of gut microbiome in Homozygous mutant mice samples, especially in terms of Patescibacteria and Defferibacterota Phyla. In both human and mice, the observed changes in the bacterial community have been associated with intestinal inflammation. These findings provide valuable insights into how the gut bacterial community, in conjunction with biomechanical factors, could potentially influence the gastrointestinal tract of DM1 patients.Item Accès libre Développer et optimiser des analogues de la neurotensine (8-13) ciblant le récepteur NTS2 afin de traiter efficacement la douleur en limitant les effets indésirables(Université de Sherbrooke, 2025-01-20) Chartier, Magali; Sarret, PhilippeLa douleur représente la première cause de consultations médicales. Son traitement demeure un grand défi médical puisque Plus de 60% des patients prenant des analgésiques sur ordonnance ne sont pas soulagés efficacement par les traitements actuels. Les opioïdes, comme la morphine, sont les plus prescrits pour traiter les patients souffrant de fortes douleurs aiguës ou chroniques. Cependanr, leur forte utilisation a conduit à une crise des opioïdes mondiale. En plus d’un nombre de décès très préoccupant, les opioïdes sont responsables d’effets indésirables dangereux tels que la dépression respiratoire, la dépendance, la tolérance ou la constipation. La recherche de nouveaux analgésiques entraînant moins d’effets indésirables est un enjeu majeur. Dans cette perspective, notre laboratoire s’intéresse à la neurotensine (NT) qui exerce une analgésie médiée par les récepteurs NTS1 et NTS2 et de manière indépendante du système opioïdergique. Toutefois, l’activation du récepteur NTS1 est également à l’origine d’autres effets physiologiques tels que l’hypothermie et l’hypotension. De plus, la NT est un peptide linéaire qui possède une demi-vie plasmatique extrêmement courte et est incapable de franchir la barrière hémato-encéphalique (BHE). Ce projet de doctorat visait donc à élaborer et à optimiser des nouveaux analogues de la NT ciblant sélectivement le récepteur NTS2 et à accroître leur passage à travers la BHE. Ces recherches ont permis le développement des premiers macrocycles peptidiques NTS2-sélectifs présentant une puissante analgésie dans trois modèles de douleur (aiguë, tonique, chronique inflammatoire) sans effets indésirables liés à l’activation du récepteur NTS1 ou aux récepteurs opioïdergiques. Ce projet se propose ensuite de recourir à plusieurs stratégies d’optimisation des peptides macrocycliques. La conjugaison du macrocycle le plus prometteur à l’angiopep-2, lui a permis de traverser la BHE et d’exercer une forte analgésie dans trois modèles de douleur après une administration périphérique. La relation structure-activité entourant les macrocycles a permis de développer une approche pour synthétiser des petites molécules. Enfin, l’avantage d’une combinaison de morphine et de macrocycle NTS2-sélectifs a été démontré pour traiter la douleur en réduisant les effets indésirables opioïdergiques.Item Accès libre Understanding the influence of hormones on the female cerebrovascular system using Magnetic Resonance Imaging(Université de Sherbrooke, 2025-01-15) Côté, Samantha; Whittingstall, Kevin; Lepage, Jean-FrançoisAbstract : Health outcomes in females are influenced by hormone state. For example, menstrual cycle hormone dysregulation, oral contraceptive use and menopause are associated with increased risk for cardiovascular disease. Despite this evidence, the unique effect of hormone states on the female brain has not been extensively studied. In recent years, there has been growing awareness of the lack of females in neuroscience studies and many initiatives have been established to ensure sex-balanced studies. This has led to significant improvement in the representation of females in studies of the brain and important findings on the influence of sex on cerebrovascular and neurodegenerative disease. This research suggests that the female cerebrovascular system might be more susceptible to injury, which is in contrast to the plethora of animal research showing hormones have a profound protective effect on the cerebrovascular system by promoting vasodilation, reducing the inflammatory response, improving outcomes after cerebrovascular injuries and even stem off cerebrovascular disease. A potential reason for the conflicting results is that hormone states and reproductive history are often not considered, even though they influence the day-to-day circulating levels of hormones. To understand the influence of hormone states on the female brain, this thesis examined how the female cerebrovascular system responds to three different hormone states: (1) The impact of acute fluctuations in estrogen and progesterone across the menstrual cycle on cerebral blood flow (CBF) estimated using arterial spin labelling (ASL), (2) the cumulative lifetime hormone exposure on T2-FLAIR derived white matter hyperintensity volumes (WMHV) in postmenopausal females of the UK Biobank; (3) the impact of testosterone on ASL estimates of CBF and vascular structure derived from time of flight magnetic resonance angiography (TOF) in adolescent transmen. Across these studies, it was found that hormone states have a significant impact on the cerebrovascular system. Our results highlight the need to include female hormone states when studying the brain.